Les champignons forment un des quatre principaux groupes de micro-organismes potentiellement responsable d'infection, les trois autres étant les parasites (qui appartiennent au règne animal), les bactéries et les virus. Ils se présentent sous forme de levures (champignons composés d'une cellule unique) ou de filaments (champignons formés de plusieurs cellules organisées en filaments qui peuvent être visibles à l'œil nu)